プロモータ配列込みで人工合成したフラグメントを、鋳型DNAとして使用することは可能です。また、ORFのみを合成したDNAから、プロモーター配列など必要な配列を含むプライマーを使用してPCRで鋳型DNAを作成して使用することもできます。しかし、遺伝子合成のメーカーによっては、納品物にタンパク質の合成反応を阻害するRNaseが含まれていることがあります。目的タンパク質が合成できない場合は、RNaseインヒビターの添加やRNaseの不活化をお試しください。
また、プラスミドの形態で納品されるのものについては、プラスミドを鋳型DNAとして用いる場合の注意点もご確認ください。