こちらは、2016年5月30日に公開された記事を再編集したものです。
PUREfrex®2.0 キットに、コントロールの鋳型 DNA として含まれている DHFR(分子量 18 kDa)に His タグを付与した鋳型 DNA を作製し、Ni アフィニティー樹脂で精製した結果を示しています。
1.用意したもの
使用したキット:PUREfrex®2.0(#PF201-0.25)
鋳型 DNA:DHFR-Hisx6 DNA
Ni アフィニティ―樹脂:Ni-Sepharose 6 FF (GE Healthcare)
Binding Buffer:50mM Tris-HCl (pH8), 500mM NaCl, 20 mM imidazole, 20mM Mg(OAc)2*
Wash Buffer:50 mM Tris-HCl (pH 8), 500 mM NaCl, 20 mM imidazole
Elution Buffer:50mM Tris-HCl (pH8), 500mM NaCl, 100mM imidazole
2.His タグつき DHFR の合成と精製
- 25 μL の反応液で 37℃、4 時間合成した。
- 合成反応液から 5 μL を抜き取った。(→ Syn)
- 残りの合成反応液(20 μL)に 80 μL の Binding Buffer を加えて希釈した。
※ Mg イオンを含まないバッファーで希釈した場合、リボソームが不安定化して、溶出画分にリボソームタンパク質が混入してきます。合成産物を精製する際は、Mg イオンを含むバッファーで合成反応液を希釈してください。 - 希釈した反応液に、Binding Buffer で平衡化した 10 µL の Ni-Sepharose 6 FF を添加し、4℃ で1 時間インキュベートした。
※ PUREfrex® で合成した His タグ融合タンパク質は、Ni アフィニティ樹脂に結合しにくい傾向があるため、多めの樹脂を使用してください。また、合成したタンパク質が、フロースルー画分に出てくる場合には、下部の「4.Ni 磁気ビーズを用いた精製」も参照ください。 - 短時間(5 秒程度)遠心し、樹脂を沈殿させて上清を回収した。(→ FT)
- 樹脂を、50 µL の Binding Buffer で 2 回洗浄した。(→ W1、W2)
- 樹脂を、50 µL の Wash Buffer で 3 回洗浄した。(→ W3、W4、W5)
- 樹脂に、50 µL の Elution Buffer を加えて DHFR-6xHis を溶出した。(→ E1、E2、E3)
- 10-20% のグラジエントゲルを用いて、SDS-PAGE を行った。
(Syn/FT/W1/W2:合成反応液 1 µL 分、W3-5/E1-3:合成反応液 4 µL 分を泳動した。) - 泳動後、ゲルを CBB で染色し、合成産物を確認した。
3.合成した DHFR-6xHis の精製結果
4.Ni 磁気ビーズを用いた精製
上記の Buffer 条件で Ni 磁気ビーズを用いた精製を行うと、His タグつきのタンパク質がフロースルー画分に出てきてしまうことがあります。このような場合、それぞれの Buffer に添加するイミダゾール等の濃度を最適化することで問題が解消されることがあります。
4-1.用意したもの
合成タンパク質:PUREfrex®2.0 で合成した His タグつきタンパク質 10 µM
Ni磁気ビーズ:PureProteome Nichel Magnetic Beads(MERCK)
Buffer:
Binding Buffer | (A) | (B) |
Tris-HCl (pH 8) | 50 mM | 50 mM |
NaCl | 500 mM | 300 mM |
Imidazole | 20 mM | 5 mM |
Mg (OAc)2 | 0 mM | 20 mM |
Tween 20 | 0.1% | 0.1% |
Washing Buffer | (A) | (B) |
Tris-HCl (pH 8) | 50 mM | 50 mM |
NaCl | 500 mM | 300 mM |
Imidazole | 20 mM | 5 mM |
Tween 20 | 0.1% | 0.1% |
Elution Buffer | (A) | (B) |
Tris-HCl (pH 8) | 50 mM | 50 mM |
NaCl | 500 mM | 500 mM |
Imidazole | 400 mM | 400 mM |
Tween 20 | 0.1% | 0.1% |
4-2.精製結果
Binding Buffer と Washing Buffer のイミダゾールなどの濃度を低くすると、His タグつきタンパク質の溶出効率が高くなりました。また、Mg イオンを Binding Buffer に添加した方が、溶出画分へのリボソームタンパク質の混入が抑えられていました。
今回は、Buffer に Tween 20 を添加していますが、こちらは、必ずしも必要ではありません。精製時の界面活性剤の効果につきましては、こちらのポスターをご覧ください。
活性型タンパク質合成のための、再構成型無細胞タンパク質合成系(PUREfrex)を用いたアプローチ